商品名 |
DNAリガーゼ(ATP、ADPまたはGTP) |
構造例 |
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同義語 |
Hbu DNAリガーゼ、複数の補因子依存性DNAリガーゼ、Szi DNAリガーゼ |
EC番号 |
6.5.1.7 |
CASレジストリ番号 |
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コメント |
古細菌「Hyperthermusbutylicus」および「Sulfophobococcuszilligii」の酵素は、ATP、ADP、またはGTPで活性があります。 それらはNAD +では活性を示しません。 この酵素は、DNA鎖と3'-ヒドロキシルおよび5'-リン酸末端とのライゲーションを触媒し、ホスホジエステルを形成し、二本鎖DNAの特定のタイプの一本鎖切断を封鎖します。 触媒作用は、ATP、ADP、またはGTPによる酵素の活性化から始まり、アデニル酸/グアノシン酸とリジン残基の間にホスホルアミド結合を形成する5段階のメカニズムによって発生します。 次に、ヌクレオチドは基質の5'-リン酸末端に転移し、キャップされた構造5 '-(3'-ジホスホアデノシン/グアノシン)-[DNA]を形成します。 最後に、この酵素は、キャップされた末端の6.5.1.1'-OH末端の求核攻撃を触媒し、その結果、ホスホジエステル結合が形成され、ヌクレオチドが放出されます。 GTPを利用できないEC?6.5.1.6、DNAリガーゼ(ATP)、EC?XNUMX、DNAリガーゼ(ATPまたはNAD +)とは異なります。 |
補因子 |
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歴史 |
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反応 |
(1)Atp +(デオキシリボヌクレオチド)(n)-3'-ヒドロキシル+ 5'-ホスホ-(デオキシリボヌクレオチド)(m)=(デオキシリボヌクレオチド)(n + m)+ Amp +二リン酸。 (2)Adp +(デオキシリボヌクレオチド)(n)-3'-ヒドロキシル+ 5'-ホスホ-(デオキシリボヌクレオチド)(m)=(デオキシリボヌクレオチド)(n + m)+ Amp +リン酸。 (3)Gtp +(デオキシリボヌクレオチド)(n)-3'-ヒドロキシル+ 5'-ホスホ-(デオキシリボヌクレオチド)(m)=(デオキシリボヌクレオチド)(n + m)+ Gmp +二リン酸。 |