DNA リガーゼ (ATP または NAD+) EC#: 6.5.1.6; ChemWhat コー​​ド：1383898

商品名 DNAリガーゼ（ATPまたはNAD +）
構造例 DNAリガーゼの構造例（ATPまたはNAD +）EC＃：6.5.1.6
同義語 Tfu DNAリガーゼ
EC番号 6.5.1.6
CASレジストリ番号
コメント 古細菌「Thermococcusfumicolans」および「Thermococcusonnurineus」の酵素は、ATPまたはNAD +のいずれかで高い活性を示し、TTP、GTP、およびCTPでは著しく低い活性を示します。 この酵素は、DNA鎖と3'-ヒドロキシルおよび5'-リン酸末端とのライゲーションを触媒し、ホスホジエステルを形成し、二本鎖DNAの特定のタイプの一本鎖切断を封鎖します。 触媒作用は、ATPまたはNAD +による酵素の活性化から始まり、アデニル酸とリジン残基の間にホスホルアミド結合を形成する5段階のメカニズムによって発生します。 次に、アデニル酸基が基質の5'-リン酸末端に転移し、キャップされた構造5 '-（3'-ジホスホアデノシン）-[DNA]を形成します。 最後に、この酵素は、キャップされた末端の6.5.1.1'-OH末端の求核攻撃を触媒し、その結果、ホスホジエステル結合が形成され、アデニル酸が放出されます。 EC？6.5.1.2、DNAリガーゼ（ATP）、EC？6.5.1.7、DNAリガーゼ（NAD +）およびEC？XNUMX、DNAリガーゼ（ATP、ADPまたはGTP）とは異なります。
補因子
歴史
反応 （1）Atp +（デオキシリボヌクレオチド）（n）-3'-ヒドロキシル+ 5'-ホスホ-（デオキシリボヌクレオチド）（m）=（デオキシリボヌクレオチド）（n + m）+ Amp +二リン酸。 （2）NAD（+）+（デオキシリボヌクレオチド）（n）-3'-ヒドロキシル+ 5'-ホスホ-（デオキシリボヌクレオチド）（m）=（デオキシリボヌクレオチド）（n + m）+ Amp +ベータ-ニコチンアミドD-ヌクレオチド。

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